电子保函是信息时代的产物，同纸质保函一样，由银行、保险公司、担保公司或其他担保人应投保人的请求，向受益人开立的一种电子化担保凭证，保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任。
电子保函是一种电子商务或信用服务工具，相关业务必须遵守《中华人民共和国合同法》、《中华人民共和国担保法》、《中华人民共和国电子签名法》以及电子商务有关法律法规的规定，遵循PKI体系的数字签名系统和数字证书技术标准和规范。通过担保机构企业数字证书为受益人签发的具有担保机构电子签名的电子保函，可以保证电子保函的真实性、防伪性、不可篡改性和不可抵赖性，与纸质保函具有同等的法律效力，同时可以进行第三方电子保函存证备案，具有、快捷、保密、全生命周期低成本、可信赖的优点。
海关总署是国内较早推广使用电子保函的政府部门，率先明确规定了电子保函业务，并成功地与金融机构合作开展了电子保函服务，开展在京津冀、长江经济带和广东地区区域通关一体化改革，在区域内海关推动电子保函“一关备案、区域通用”改革试点，打破关区界限，降低通关成本，促进贸易便利化。
发行主体：
- 银行保函：银行保函由银行作为发行主体，因其信誉稳定且具备一定的监管体系，在国际贸易中得到广泛认可。银行保函往往具有较高的可靠性和可信度。
- 商业保函：商业保函可以由各类非金融机构或保险公司发行，这些发行主体根据市场需求和风险评估来提供保函服务。商业保函的可靠性因发行主体的不同而有差异。